Depuis 2000, MerTerre contribue à la réduction de la pollution des milieux aquatiques par les déchets en améliorant les connaissances de cette pollution qu’elle met à disposition des acteurs de terrain et des décideurs. Elle identifie, coordonne et valorise ceux qui organisent des nettoyages citoyens et réalise des outils éducatifs, notamment via l’animation de la plateforme Zéro Déchet Sauvage, créée dès 2021.